Maksājumu iestāde (2004.-2006.gada plānošanas periodam) un sertifikācijas iestāde (2007.-2013.gada plānošanas periodam) saskaņā ar Eiropas Savienības (turpmāk – ES) regulās noteikto ir viena vai vairākas valsts reģionālās vai vietējās iestādes vai struktūras, ko izraugās dalībvalsts, lai apstiprinātu izdevumu deklarācijas un maksājumu pieteikumus, pirms tos nosūta Eiropas Komisijai, un saņemtu maksājumus no Eiropas Komisijas.
Maksājumu iestādei un sertifikācijas iestādei, tāpat kā citām ES politiku instrumentu ieviešanā iesaistītajām iestādēm, ir jānodrošina instrumentu darbība atbilstīgi Eiropas Kopienas interesēm, jānodrošina efektīva instrumentu vadība un uzraudzība saskaņā ar ES regulām un vadlīnijām.
Valsts kase kopš 2004.gada 1.maija ir maksājumu iestāde šādiem Eiropas Savienības politiku instrumentiem:
- ES struktūrfondiem;
- Kohēzijas fondam;
- Eiropas Kopienas iniciatīvai EQUAL
un kopš 2007.gada 1.janvāra sertifikācijas iestāde un maksājumu iestāde šādiem Eiropas Savienības politiku instrumentiem:
- Eiropas Reģionālās attīstības fondam;
- Eiropas Sociālajam fondam;
- Kohēzijas fondam.
